Podigao ga je Vukan Nemanjić. Tačno vrijeme građenja bogomolje i osnivanje manastira nije poznato. Po Vladimiru Petkoviću, bogomolja je mogla biti iz 13-14. vijeka, ali takvo rano datovanje nije potvrđeno arheološkim nalazima i dosadašnjim istraživanjima. Iako po graditeljskom rješenju crkva može biti i iz srednjeg vijeka, sudeći prema načinu gradnje, postojanju drvenog trijema na zapadu, svojstvenom podu sličnom onom u crkvi Svete Trojice manastira Majstorovine, najvjerovatnije da je crkva podignuta krajem 16. vijeka. Iz tog vremena potiču i najstariji pisani podaci. Tako je 1615. godine eklisijarh Longin priložio Minej napisan pri nastojatelju Antoniju, a posebno je zanimljiv zapis piščev na Mineju po kome je knjigu pisao „pod crkvenom strehom sedeći“. Značajan je podatak i natpisa nad vratima u priprati u kome se pominje nastojatelj Makarije i za koji se smatra da potiče možda iz 17. vijeka, prije 1615. godine. Po Vladimiru Petkoviću, manastir Bliškovo je odavno u ruševinama, ali tačno vrijeme rušenja nije utvrđeno. Sudeći po tome da se manastir spominje i početkom 18. vijeka, vjerovatno je do rušenja došlo poslije tog vremena.

Posljednji nastojatelj ovog manastira, Đorđe Varaga, pobjegao je od turskog bezakonja u Svetu Goru. Bliškova se pominje i u Sopoćanskom pomeniku s početka 18. vijeka.